Sự đột biến của virus sẽ tạo ra rất nhiều dạng khác nhau như chúng ta đang thấy hiện nay có hai dạng là Covid Variant và Covid Omicron.
Theo nghiên cứu cho biết sự đột biến xày ra theo một trong ba cách là thay thế một amino acid, thêm vào một amino acid, bỏ đi một amino acid như thí dụ dưới đây.
CODING STRAND 5’ TCA GAG GTG AAA TGC TAT GGT 3’
Amino acids Ser Glu Val Lys Cys Tyr Gly
1-Substitution 5’ TCA GAG GTG ACA TGC TAT GGT 3’
Amino acids Ser Glu Val Thre Cys Tyr Gly
2-Insertion 5’ TCA GAG GTG CGC AAA TGC TAT GGT 3’
Amino acids Ser Glu Val Arg Lys Cys Tyr Gly
3-Deletion 5’ TCA GAG GTG AAA TGC TAT GGT 3’
Amino acids Ser Glu Val Cys Tyr Gly
Mức độ đột biến trung bình của RNA Virus nhanh hơn DNA-based Virus
khoảng100 lần nên vaccines và thuốc trị bịnh trở nên không còn hửu hiệu rất mau chóng.
Phòng thí nghiệm
LOS ALAMOS NATIONAL LABORATORY
LOS ALAMOS, N.M., July 2, 2020
---------------------------
Đã nghiên cứu tìm sự đột biến của Covid-Wuhan, và đã phổ biên tài liệu “Tracking SARS-CoV-2 Spike mutations” (Theo doỉ nhứng đột biến của Spikes của SARS-CoV-2 ).
Spike của con Covid Wu Han cấu tạo bởi 1,273 amino-acids.
Amino acid ở vị trí 614 là aspartic D (Aspartic GAT, GAC ).
Nhưng sau đó D đột biến thành amino acid G (glycine GGT, GGC, GGA, GGG);
Viết ký hiệu S D614G để cho biết Spike S đã đột biến tại vị trí 614 từ aspartic D thành glycine G .
Spikes là muỉ nhọn tấn công phổi. Sự đột biến của Spikes làm cho vax hết hiệu quả.
Sự đột biến như chúng ta đã biết là do :
· Những cắt bỏ amino acids (Deletions)
· Hoắc do thay thế những amino acids (Substitutions).
Nhưng nếu cắt bỏ nhiều quá thi Covid không còn hoạt động nữa.
Còn thay thế nhiều quá thi chỉ có một số ít amino acids có thể thay thế lẫn nhau nhưng họat động của Covid vẫn như cũ.
Theo nghên của Dr. Bette Korber, tại Los Alamos National Laboratory từ 999 bịnh nhân ở UK cho biết :
Biến thể S D614G lây nhiễm nhiều hơn S D614 nhưng không nguy hiểm hơn.
Biến thể S D614G xuất hiện nhiều nơi bịnh nhân trẻ tuổi. (younger age of patients).
Covid Omicron có thể có nhiều hơn 50 đột biến. Spikes của Omicron có thể có nhiều 30 đốt biến.
Sự đột biến theo phương pháp thay
thế (substitution) của Omicron Spike đã được tìm thấy như sau theo tài
liệu của WHO ngày Nov, 26, 2021 :
Covid Omicron có thể có nhiều hơn 50 đột biến. Spike của Omicron có 30 đột biến thay thế, 3 đột biến nhỏ huỷ bỏ và 1 đột biến nhỏ ghép thêm vào như dưới đây.
(30 amino acid substitutions, 3 small deletions, 1 small insertion).
A67V, del69-70, T95I, del142-144, Y145D, del211, L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F
TIÊU CHUẨN CODING CỦA DNA VÀ GENE(CODING STANDARD OF DNA)
Theo nghiên cứu, các khoa học gia đã tìm thấy một simple amino acid dùng để tạo ra protein cần phải có 3 nucleotides hoặc 3 bases nên đặt ra quy luật gọi triplet.
A : adenine ; G : Guanidine ; T : Thymine ; C : Cytocine.
T,C là single-ring pyrimidine bases. A, G là double-ring purine bases
Triplet là một nhóm gồm có 3 chữ lấy từ A,T,C,G (Tên của 4 bases)
Thí du triplet AGC chứa amino acid tên là SERINE, ACC là amino acid THREONINE.
Triplet còn có tên chuyên môn là CODON.Trường hợp đặc biệt có một số nhiều amino acids cần nhiều codons.
Khởi đầu của codon là ATG và kết thúc là TAA TAA (double codon).
Những codons nào có đặc tính tạo ra protein và đặc tính di truyền thì được đặt tên là GENE.
Giữa 2 GENES có một khoảng của DNA được đặt tên là JUNK DNA vì chưa tìm được nhiệm vụ của nó.
NHỮNG AMINO ACIDS ĐÃ TÌM THẤY TRONG CODONS .
Ghép 3 chữ của 4 chữ A, C, G, T taọ ra được 64 codons chứa 20 amino acids có tên như sau.
-------------------
1-Phenylalanine F TTT, TTC
2-Methionine M ATG
3-Cysteine C TGT, TGC
4-Alanine A GCT, GCC, GCA, GCG
5-Glycine G GGT, GGC, GGA, GGG
6-Isoleucine I ATT, ATC, ATA
7-Leucine L CTT, CTC, CTA, CTG, TTA, TTG
8-Valine V GTT, GTC, GTA, GTG
9-Proline P CCT, CCC, CCA, CCG
10-Threonine T ACT, ACC, ACA, ACG
11-Serine S TCT, TCC, TCA, TCG, AGT, AGC
12-Tyrosine Y TAT, TAC.
13-Tryptophan W TGG
14-Glutamine Q CAA, CAG
15-Asparagine N AAT, AAC
16-Histidine H CAT, CAC
17-Glutamic acid E GAA, GAG
18-Aspartic acid D GAT, GAC
19-Lysine K AAA, AAG
20-Arginine R CGT, CGC, CGA, CGG, AGA, AGG
Stop codons Stop TAA, TAG, TGA
------------------
Quan sát bản liệt kê trên , chúng ta thấy có nhiều amino acids chiếm hơn một codon.
